Няма разлика. Чушката и пиперът са едно и също нещо - Capsicum annuum.
Има различни сортове чушка / пипер, като например: камба, капия, сиврия, ратунд, чорбаджийска чушка.
Ако в някое село където и да е, наричат нещата с техни си имена, то това не променя останалата част от вселената.